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마크베이스 6.0 에서는 데이터베이스 전체 또는 Tag, Log, 테이블에 대한 증분 백업이 가능하다. 이전에 백업한 이후에 입력된 데이터를 백업하는 명령이 추가되어 전체 데이터의 Full backup만을 사용할 경우에 발생할 수 있는 백업 시간이 짧아지고, 저장 공간을 절약할 수 있다. 자세한 사항은 관련 페이지을 참고하라.

증분 백업은 이전에 수행한 Full back뜨는 이전 증분 백업 파일을 기반으로 수행한다. 

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